一星期之后，地底研究所的某间研究室里，传出赛吉慌张的喊。
这一星期之间，出现大量怪物将生物转化为变异体，各国政府慎重应对，在受害较少的地下设施建立避难所，例如百货公司地下层和地下铁系统。
来栖等人任职的研究所位在地底，没有受到危害，研究起来比较安全，所以日本国内的对策总部也设立在此。
而这座地底研究所里面的研究员以及被各研究所挖角的来栖、莱恩和赛吉三位优秀人才，也被徵召进入对策总部。
来栖是率先活捉变异体进行生态调查的人，成果获得肯定，所以担任室长，率领对策总部中的研究团队。莱恩、赛吉和其他研究员也加入团队帮忙研究变异体。
除了原本就住在这里的丽莎之外，许多活跃于英雄圈的人也住进地底研究所的对策总部，如此一来碰到状况就能分享资讯，及时出击或防御。
但实际上英雄并不常在研究所，因为凝胶状怪物大量出现，英雄必须经常出击保护民众。
现在人们已经无法放心在地面上活动，只能躲进铜墙铁壁、无法渗透的密室，避免被那些凝胶状的怪物抓住同化。
「赛吉……你现在冷静点没有？」
「这种状况叫我怎么冷静！你现在还冷静得下来才奇怪！莱恩都赶去找那个被活捉的变异体，要收集资讯了！」
「惊慌失措不会改变局势啊。」
「混帐……难得状况都要好转了，怎么突然又这样！」
赛吉说得没错，国家成立对策总部之后，状况也开始逐渐好转。
因为来栖等人证实，超人比较不怕被怪物融合成变异体，所以超人才能在怪物大量出没的地面上放心活动。
超人和人类之外的动物，与怪物交融的速度异常缓慢，来栖马上就发现问题出在基因架构上。
动物就不用说了，超人经过进化之后，基因架构与人类稍稍不同，遭到怪物攻击也不会马上融合。只要在被融合之前破坏怪物的核心，就能避免受害。
另外怪物必须直接碰触目标才能融合，所以只要穿上防渗透装甲，或者搭乘军方的战斗机，不让怪物直接碰触皮肤，那么非超人的普通人也能顺利作战。
再者，来栖等人发现变异体虽然和超人一样发生了迅速的进化，但是变异体也能被麻醉，细胞遭到燃烧也会死亡，那高强的防御力自然就派不上用场。
人类掌握变异体的弱点，全力偷袭没有动作的变异体，慢慢削减变异体的数量。
状况确实正在好转，但是以防万一，各国在众多英雄的护卫之下，开始建造新的专用地底居住区，好收容更多人类。
日本所建造的新地底居住区，就是后来的诺亚。
「我们本来就有这个打算了吧？所以……我们当时才会赌命拿到这个样本。应该要庆幸我们当时有采取行动。」
「……这么说也没错，不过我们没猜到对方会怎么做……谁想得到对方会这样联手出击呢！」
可惜，局势急转直下。
原本的变异体，只要人类不出手攻击就会静观其变。所以人类利用优势发动偷袭，局势才会好转。但是不知为何，变异体突然发动总攻击了。
「不行……收到的情报没有错，刚刚我去看，那个被活捉的研究用变异体也开始大闹，几乎要扯坏拘束器了。」
研究室里为了意外状况兵荒马乱的时候，莱恩一脸憔悴地回来了。
「还有其他能报告的事情吗？比方说行动有没有一致性……像这样的？」
来栖这么问，莱恩面有难色地摇头。听到这没有希望的报告，来栖和其他研究员都不知该如何是好。
「拿去。」赛吉突然喊了一声，把一部平板终端机丢给来栖。
「情报太少，我不敢把话说满……但是有报告说变异体开始协助怪物去附著生物。它们开始破坏装甲、压制英雄……英雄差点就要被吸收了。」
「喂喂……本来以为超人英雄不会被吸收，这下也有危险了吗？」
情报来了，但令人听不下去，莱恩忍不住长叹一口气。
「这太棘手了吧……超人只是比较不容易被吸收而已，要是被压制住等著吸收，超人会变成最凶残的变异体吧？」
「是啊……普通人都变得那么强了，要是超人成了变异体……不知道会变成怎样棘手的怪物。」
目前还没有超人牺牲，但是人类以外的生物变异体已经是很大的威胁，莱恩和赛吉想到超人牺牲的下场就脸色发青。
「到底是什么原因让它们突然有动作呢……必须先搞清楚这点。是不是从哪里传送电波发号施令，还是变异体总数超过一个门槛就会这样……我想过很多可能，总之只要掌握原因，或许就能再次阻止它们活动。」
「但是我们也只能防守啊……要是能找到引发这次大乱的罪魁祸首，局势可能会改变……可是我们连这些怪物从哪里来都不知道啊。」
莱恩双手一摊，表示不管有多少应急措施，没有解决最根本的问题就没意义。要是能知道这些怪物从哪里冒出来，或许还有转机。莱恩无助地看看赛吉。
赛吉只是摇摇头，也不知道怪物从哪里来的。
「赛吉，各国都说跟自己无关对吧？每个国家都灾情惨重啊。」
「对，但是也可能假装自己是受害者……现在要是不找出源头，光想办法应急可是没完没了喔……喂，来栖，你有听到吗？」
赛吉跟莱恩讨论如何解决问题，发现来栖正在发呆，赛吉就摇晃来栖的肩膀喊他。
「你这种时候发什么呆啊？」
「嗯？啊……没什么，我只是听了原因，想东想西而已。大家认为是某个国家引发了这次的混乱……我想说真的是这样吗？」
「…………你怎么觉得不是？」
赛吉只觉得是某个坏蛋引发这场混乱，听了来栖这么说显得有点兴趣。他严肃地竖起耳朵，希望能找到事发原因的线索。
「生物武器是最可怕的武器……如果这是生物武器的杰作，把普通人变成怪物，那可真是惊天动地的武器了。连我们的研究所都想不到这种坏到骨子里的武器。但是这种武器太没节制，我看不出有什么好处。」
「……意思是没办法当武器来用？」
来栖点头同意这句话。
如果怪物是武器，应该要有特定的目标。假设某个国家为了对全世界展现武力而释放武器，却对全世界造成影响，只会与世界为敌，无法获得利益。
毋宁说要是找不到应对方法，世界甚至可能会毁灭。
「搞不好是追求毁灭世界的恐怖分子？」
「这也不是不可能，但是我不认为这种恐怖组织有技术跟资金研发这种武器。」